MIN 2 Bogor didukung dengan berbagai fasilitas penunjang pembelajaran, antara lain:
- Ruang kelas representatif
- Ruang guru dan ruang kepala madrasah
- Ruang Tata Usaha
- Perpustakaan
- Laboratorium / sarana TIK
- Musholla
- UKS
- Toilet siswa dan guru
- Halaman dan lapangan kegiatan
- Sarana kebersihan dan keamanan